中国科学院西双版纳热带雨林生态系统定位研究站的前身为1958年成立的云南热带森林生物地理群落定位研究站和1959年成立的中国科学院昆明植物研究所实验植物群落研究室，1964年站、室合并组建成立。现隶属于中国科学院西双版纳热带植物园。是中国科学院生态系统研究网络（CERN）和国家重点野外科学观测实验站之一。